肿瘤干 🐈 细胞环状rna(肿瘤干细胞mrnasi计算)
- 作者: 王砚舟
- 来源: 投稿
- 2025-09-29
1、肿瘤干细胞 🐶 环 🦅 状rna
肿瘤干细 🐴 胞环 💮 状RNA
环状RNA(circRNA)是RNA一种共价闭合的分子,没有5'端帽子和端3'尾。近,年 🕸 来研究表明,circRNA在,癌症中发挥着重要作用包括调控肿瘤干细胞(CSC)。
CSC是一类自我更新、高致癌性的细胞,具、有驱动肿瘤 🦉 发生复发和耐药的能力。circRNA被CSC认,为CSC是、的、重。要调控因子通过影响的增殖分化侵袭和转移
circRNA与CSC调控 🐞 的机 🌴 制
circRNA可以通过多 🍁 种机制调控CSC:
海绵效应: circRNA可以作为miRNA的海绵,与miRNA结,合miRNA并,阻止 🦉 其靶向作用从而上调靶基因的表达进而调节的CSC生物学行为。
调节转录: circRNA可 🐶 以通过与转录因子或转录共激活因子相互作用 🕷 调,控,基因转录影 🐺 响CSC的维持和分化。
翻译调控: 一些circRNA具有内部核糖体进入位点(IRES),可以驱动自身或其他mRNA的 🐝 翻译进,而促 🦍 进的CSC增殖和存活。
上调CSC相关通路: circRNA可以通过激活Wnt、Shh或Notch等 🐳 CSC信号通路来促进的自我更新和增殖。
特 🍀 定circRNA与 🐶 CSC的关 🐒 联
特定的circRNA与的CSC调节密切相关 🦅 :
circLARP1: circLARP1在多种癌症中上调 🐼 ,促进CSC的自我 🐱 更新和化疗耐药。
circNRIP1: circNRIP1在肺 🌹 癌 🌺 中增加,促进CSC的增殖和 🦢 侵袭。
circHIPK3: circHIPK3在胶质 🐋 瘤中高表达,维持CSC的自 🐳 我更新和分化阻滞。
circRNA作为 🌺 癌症治疗靶点 🐘
由于circRNA在CSC调控中的作用,它们被认为是 🐒 潜在的癌症治疗靶点。通过靶向特 🐛 定circRNA,可CSC以,抑。制活性提高治疗效果
结论肿瘤干细胞 🌿 环状RNA是癌细胞中发现 🐋 的一类新型非编码RNA,它们 🌾 在CSC调控中发挥着至关重要的作用。了解的circRNA机。制对于开发新的抗癌疗法具有重要意义
2、肿瘤干细胞mrnasi计 🌷 算
肿瘤 🐈 干细胞 mRNA 计算
步骤:1. 收集肿瘤组织样品:获取肿瘤组织活检或手术 🐶 标本。
2. 提 🌵 取 RNA:使用提取 🕸 RNA 试剂盒从组织中提取 🐵 总 RNA,包括 mRNA。
3. 逆转录合成 cDNA:利用逆转录 🌾 酶将转录成 mRNA 互补 DNA (cDNA)。cDNA 是 mRNA 的 DNA 单。链副本
4. 选择性扩增肿瘤干细 🦆 胞标记物 mRNA:使用实时定量 PCR (qPCR) 方法选择性扩增,与肿瘤干细胞相关的 mRNA。常见标记物包括 CD133、CD44、ALDH1 和 Oct4。
5. 计算基因表达量:使用 2^[ΔΔCt] 法或其他定量 PCR 分析 🌸 方法计算每个标记物的表达量。ΔΔCt 是靶基因 Ct 值 Ct 与。对照基因值之差的差值
6. 归一化:将肿瘤 🦍 干细 🐝 胞标记物 mRNA 的表达量 ☘ 归一化为内参基因的表达量,例如 GAPDH 或 βactin。
注意 💮 事项:
使用高质量的 🦟 RNA 提取试剂盒和逆转录酶对于获得准确的结果至关重要。
选择合 🐅 适的肿瘤干细胞标记物很重要,因为不同的肿瘤类型和分期可能会表达不同的标记物。
应使用多个标记物来提高准确性和可靠性 🌲 。
将结果与正常组织样本或已知缺乏 🐬 肿瘤干细胞的组织样本进行比较。
应用:肿 🕸 瘤干 🐠 细胞 mRNA 计算用于:
研究肿瘤 🐘 干细胞在肿瘤发生和进展中的作 🦢 用。
开发靶向肿瘤 🐒 干细 🦆 胞的治疗策略。
评估肿瘤 🐠 治疗的疗效。
预测 🍁 患者的 🌴 预后和 🐼 治疗反应。
.jpg)
3、环状rna与 🦍 肿瘤的关系
环状RNA与肿瘤 🐵 的关系
环状RNA(circular RNA,circRNA)是RNA,一类新型的非编码因其环 🦊 状结构而具有高度稳定性和耐降解性。近,circRNA年来与肿瘤的发生发、展和。治疗的关系备受关注
circRNA在 🦈 肿瘤 🌺 中的致癌作用
调控肿瘤 ☘ 细胞 🌻 增殖: некоторые circRNA могут促进 🦍 肿瘤细胞增殖,例circ如在肝癌中通过上调CDK6表达促进细胞增殖。
抑制细胞凋亡: circRNA也可以抑制肿瘤细胞凋 🌾 亡,例circ如在胃 🌹 癌中通过下调miR143表 ☘ 达抑制细胞凋亡。
促进肿瘤细胞侵袭和转移 🦅 : circRNA参与肿瘤细胞侵袭和转移的多个过程,例circ如在结直肠癌中通过上调MMP9表达促 💮 进细胞侵 💐 袭。
影响肿瘤微环境: circRNA还可以影响肿瘤微环境,例circ如在肺癌中通过调节巨噬 🌿 细胞极化影响肿瘤免疫应答。
circRNA在肿瘤中 🦈 的抑癌作用
抑制肿瘤细胞增殖: 一些 🍀 circRNA具有抑癌作用,例如circPSMC3在乳腺癌中通过下调CDK2表达抑制细胞增殖。
促进细胞凋 🦈 亡: circRNA也可以促进 🐳 肿瘤 🐺 细胞凋亡,例如circKLK11在肾癌中通过上调miR124表达促进细胞凋亡。
抑制肿瘤 🌾 细胞侵袭和转移: circRNA可以通过抑制肿瘤细 🌷 胞侵袭和转移来发挥抑癌作用,例circ如在胶质瘤中通过下调VEGF表达抑制细胞侵袭和转移。
circRNA作为 🕊 肿 🌾 瘤标志物 💮
由于circRNA在不同肿瘤类型中的表达异常,它,们有望成为肿瘤标志物用于早期诊断、疗效监测和预后评估。例如在,circ胃,癌circ中的。高表达与较差的预后相 🍀 关而在肺癌中的低表达与较好的预后相关
circRNA靶向 🐕 治疗 🐛
circRNA的致癌或抑癌作用,使其成为潜在的靶向治疗靶点。通circRNA过,开circRNA发,靶向 🐧 的。小分子抑制剂或激活剂可以抑制或激活特定的表达从而影响肿瘤细胞的生物学行为和改善治疗效果
结论circRNA与肿瘤的关系是一个复杂而多方面的 🐶 领域。深circRNA入了解在肿瘤发生 🐴 发、展和治疗中的作用,有。望为肿瘤患者带来新的诊断 🐳 和治疗选择
4、肿瘤 🐎 干细胞marker
表 🐝 面标 🦈 记:
CD133:在髓母细 🦅 胞瘤、胶质瘤和肺癌 🐶 等 🍀 多种癌症中发现。
CD44:广泛表达于 🌾 多种癌症 🐎 干细胞,与细胞粘附和肿瘤转移有关。
ALDH1:一种酶标记,用于鉴定前 🐶 列腺癌和乳腺癌的癌症干细胞。
EpCAM:一种 🐺 上皮细胞粘附分子,在结肠 🐬 癌和乳腺癌的癌症干细胞中表 🦅 达。
CD105:一种血 💐 管内皮生长因子 🐴 受体,在多种癌症中与癌症干细胞有关。
转录 🌼 因子 🦈 :
Oct4:胚胎干细胞相关的 🐋 转 🦁 录因子,也在 🐞 多种癌症干细胞中表达。
Sox2:另一个 🦄 胚胎干细胞相关的转录因子,在癌症 🐧 干细胞中 🦢 调控自我更新。
Nanog:一种转录因子,与,胚胎干细胞的维持和多能性有关也在癌症干细胞中 💐 发现。
Myc:一种 🦋 原癌基因,在多种癌症中与 🐟 癌 🐯 症干细胞的增殖和存活有关。
Klf4:一种转录因子,在乳 🐛 腺癌和结肠 🕸 癌中与癌症干细胞的耐药性有关。
其 💐 他标记 🌺 :
ATP结合盒转运体 (ABC):一组膜转运蛋白,与癌症干细胞的药 🌷 物耐药有关。
富含丝氨酸蛋白的成纤维细胞激活蛋白 (FAP):一种 🐡 细胞外基质蛋白,在多种癌 🦋 症中与癌症干细胞的侵袭和转移有关。
CD90:一种细胞表面 🐠 糖蛋白,在多种癌症中与癌症干细胞的迁移和侵袭有关。
CD24:一 🌼 种细胞表面标记 🌲 ,在乳腺癌和肺癌 🐞 的癌症干细胞中表达。
Notch:一种信号通路,在多种癌 🐶 症中与癌症干细胞的自我更新和分化 🌹 有关。